FORMATO FASTA

EL formato fasta es un formato de fichero informático basado en texto, utilizado para representar secuencias bien de acidos nucleicos, en el que los pares de bases o los aminoácidos se representan usando códigos de una única letra. El formato también permite incluir nombres de secuencias y comentarios que preceden a las secuencias en sí.

La simplicidad del formato FASTA hace fácil el manipular y analizar secuencias usando herramientas de procesado de textos

Una secuencia bajo formato FASTA comienza con una descripción en una única línea (línea de cabecera), seguida por líneas de datos de secuencia. La línea de descripción se distingue de los datos de secuencia por un símbolo '>' (mayor que) en la primera columna. La palabra siguiente a este símbolo es el identificador de la secuencia, y el resto de la línea es la descripción (ambos son opcionales). No debería existir espacio entre el '>' y la primera letra del identificador. Se recomienda que todas las líneas de texto sean menores de 80 caracteres. La secuencia termina si aparece otra línea comenzando con el símbolo '>'; esto indica el comienzo de otra secuencia. Un ejemplo simple de una secuencia en el formato FASTA puede ser:

LCLYTHIGRNIYYGSYLYSETWNTGIMLLLITMATAFMGYVLPWGQMSFWGATVITNLFSAIPYIGTNLV
EWIWGGFSVDKATLNRFFAFHFILPFTMVALAGVHLTFLHETGSNNPLGLTSDSDKIPFHPYYTIKDFLG
LLILILLLLLLALLSPDMLGDPDNHMPADPLNTPLHIKPEWYFLFAYAILRSVPNKLGGVLALFLSIVIL
GLMPFLHTSKHRSMMLRPLSQALFWTLTMDLLTLTWIGSQPVEYPYTIIGQMASILYFSIILAFLPIAGX
IENY